攝影師工藤太郎在搭乘飛機(jī)途中目睹一枚太空艙墜入大海，經(jīng)確認(rèn)竟是四個(gè)月前離奇失蹤的無(wú)人木星探測(cè)器赫利俄斯7號(hào)。返國(guó)后工藤受托陪同開(kāi)發(fā)公司調(diào)查隊(duì)前往塞吉?dú)W島執(zhí)行考察任務(wù)，而該島嶼正位于赫利俄斯7號(hào)墜落海域附近。調(diào)查隊(duì)抵達(dá)后不久，塞吉?dú)W島突然出現(xiàn)巨型怪獸杰索拉，其異常活動(dòng)與探測(cè)器墜毀事件產(chǎn)生直接關(guān)聯(lián)。隨著調(diào)查深入，科研人員發(fā)現(xiàn)赫利俄斯7號(hào)搭載的未知物質(zhì)因墜毀引發(fā)生態(tài)異變，導(dǎo)致海底怪獸群蘇醒。工藤與調(diào)查隊(duì)在追蹤怪獸蹤跡過(guò)程中，目睹杰索拉與其他變異生物加尼美、卡美巴展開(kāi)激烈領(lǐng)地爭(zhēng)奪戰(zhàn)。最終人類通過(guò)聲波干擾裝置引導(dǎo)怪獸群退回深海，暫時(shí)解除危機(jī)，但探測(cè)器攜帶的外星物質(zhì)仍潛伏海底形成未知隱患。