電影在法國(guó)展開(kāi),反派與空中都市王子(諏訪部順一配音)攜一名嬰兒乘坐飛艇時(shí)遭遇空賊劫持,魯邦三世中途現(xiàn)身爭(zhēng)奪寶物。少女空賊尤緹卡(石川由依配音)攔截魯邦未果反遭冒犯,憤而掌摑致其墜落塞納河。魯邦意外帶著嬰兒及一塊記載空族寶藏位置的水晶返回?fù)?jù)點(diǎn),與次元大介陷入撫養(yǎng)嬰兒的窘境,并在盜竊中持續(xù)攜帶此物。錢形幸一警部循跡追蹤至羅馬,因魯邦關(guān)聯(lián)性被反派勢(shì)力策反奪嬰。反派秘書真實(shí)身份為峰不二子(澤城美雪配音),其立場(chǎng)成謎。魯邦與次元遭追捕逃入古羅馬斗獸場(chǎng)期間,尤緹卡趁機(jī)奪回嬰兒返航基地,魯邦緊追至空賊據(jù)點(diǎn)后揭露內(nèi)部叛徒。最終族長(zhǎng)(菅生隆之配音)引爆基地與敵人同歸于盡,魯邦、次元及尤緹卡攜嬰兒逃脫。該片揭示嬰兒身份為空族末裔公主,水晶實(shí)為開(kāi)啟天空之城遺產(chǎn)的關(guān)鍵信物。