自魔法作為一種技術被確立以來，約一個世紀后的2095年4月，國立魔法大學附屬第一高中迎來了兩兄妹——表面被認定為魔術科差生的達也與被譽為完美巫師的優等生深雪。這對因過于親密常被誤認為戀人的兄妹，曾在數年前保持著類似女主人與仆人的疏離關系。轉折源于三年前的沖繩事件：當時深雪因意外觸發"滅跡魔法"陷入生命危機，達也憑借隱藏的高超能力突破限制完成救援。這次生死考驗不僅解開了深雪對自身力量的心結，也讓兄妹二人直面內心羈絆的本質。隨著深雪開始主動接觸達也的處境，曾被刻意維持的距離逐漸消融，而達也作為"雜音清除者"的特殊身份與深雪真正覺醒的代價，成為貫穿兩人命運的核心伏筆。