故事設(shè)定在《哥斯拉2：怪獸之王》里哥斯拉和泰坦巨獸之間的驚天大戰(zhàn)夷平舊金山、怪獸真實(shí)存在成為全球共識(shí)后的世界。凱特·米切爾在發(fā)現(xiàn)新的驚人秘密后，被迫面對(duì)來(lái)自未知?jiǎng)萘Φ木薮笸{。為揭開家人失蹤與神秘組織"帝王計(jì)劃"的關(guān)聯(lián)，她展開橫跨多個(gè)大洲的冒險(xiǎn)旅程。與此同時(shí)，前帝王組織成員之子詹姆斯·陸在東南亞某國(guó)監(jiān)獄意外接觸到泰坦巨獸相關(guān)遺跡，逐漸揭露該組織持續(xù)二十年的秘密研究項(xiàng)目。兩條故事線最終交匯于帝王計(jì)劃隱藏在太平洋深處的終極實(shí)驗(yàn)基地，這里不僅藏有凱特父親留下的關(guān)鍵線索，更揭示出人類試圖控制泰坦巨獸所引發(fā)的全球性危機(jī)。隨著各勢(shì)力對(duì)遠(yuǎn)古生物能量的爭(zhēng)奪升級(jí)，凱特與詹姆斯必須聯(lián)手阻止即將爆發(fā)的更大規(guī)模怪獸災(zāi)難。