刀劍男士從平安京修正歷史歸來的慶功宴后，未來的本丸突然爆發時間異常現象。為解決異變并尋找離隊的山姥切國廣，三日月宗近穿越至西歷2012年東京，在這里他遇見能聽見物品聲音的靈力高中生森下佳耶。兩人發現"收尾人"組織正試圖篡改歷史，通過摧毀重要時間節點的靈力節點引發時空崩塌。在和泉守兼定、加州清光等刀劍男士的協助下，眾人與反派展開對抗。森下佳耶通過特殊靈力定位到被封印的時空裂縫，三日月宗近則以本體刀劍為媒介修復受損歷史坐標。最終眾人成功阻止陰謀，恢復時間軸穩定，并在現世與山姥切國廣重逢。影片延續游戲《刀劍亂舞》的時空守護主題，展現刀劍男士跨越時代的使命傳承。