1954年美國佐治亞州鄉村，懷孕少女瑪麗·路易斯（薩布麗娜·科恩飾）為躲避酗酒暴力的父親，逃入偏遠山區的圣阿加莎修道院。這座由維多利亞式別墅改造的封閉場所實為非法收容所，掌權修女以宗教名義實施暴政。瑪麗被迫接受洗腦式規訓并更名阿加莎，每日在嚴苛勞役中承受精神摧殘。隨著孕期推進，修女長（卡羅琳·赫尼塞飾）暗示其腹中胎兒將作為"神圣獻祭"，迫使阿加莎在分娩前夜策劃逃亡。暴風雨中她發現修道院地下室的詭異祭壇與歷代孕婦遺骸，最終在追逐搏斗中失足墜崖。次日新聞報道顯示其尸體被山洪沖走，修道院則以"圣母升天"儀式掩蓋真相。三個月后，當地教堂悄然接收了標注為"阿加莎遺孤"的男嬰檔案。