位于南洋腹地的一個(gè)無(wú)名小島隱藏著科技發(fā)達(dá)的實(shí)驗(yàn)室，科學(xué)家在此通過(guò)提取遠(yuǎn)古遺跡中的夢(mèng)幻基因并實(shí)施基因改造工程，人工培育出最強(qiáng)寶可夢(mèng)超夢(mèng)。超夢(mèng)誕生后因身份認(rèn)知困惑而暴走，被神秘男子以操控世界的承諾蠱惑聯(lián)手對(duì)抗各地訓(xùn)練家。盡管接連擊敗眾多對(duì)手，超夢(mèng)始終無(wú)法解答"我是誰(shuí)"的核心疑問(wèn)，內(nèi)心矛盾激化至頂點(diǎn)后再度脫離控制，帶著對(duì)人類的憎恨重返誕生地。當(dāng)科學(xué)家舊部率眾追至小島時(shí)，超夢(mèng)與入侵者展開(kāi)激烈對(duì)戰(zhàn)。最終夢(mèng)幻現(xiàn)身引導(dǎo)同類相遇，在雙重鏡像映照下超夢(mèng)領(lǐng)悟到生命本質(zhì)并非源于被創(chuàng)造的形態(tài)，而是存在于自我意識(shí)的確立過(guò)程。伴隨著實(shí)驗(yàn)室崩塌與追擊者的撤離，超夢(mèng)在晨曦中凝視新生的夢(mèng)幻基因體，最終選擇孤獨(dú)地踏上尋求存在意義的永恒之旅。