環境學者西山玄學長期堅持揭露工業污染真相，同時研究家族傳承的《諸世紀》預言手稿。女兒まり子與歸國學者中川相戀之際，西山警告新人類不應延續后代。隨后日本爆發多重生態災難：夢之島出現因防腐劑AF2變異的巨型蛞蝓，各地畸形兒激增，鋅礦區誕生超能力兒童。當赤潮摧毀中川故鄉漁村時，兩人在逃生船上結合。西山警示過度開發將導致文明毀滅卻遭輿論抨擊，國際環保會議更因發達國家與發展中國家對立陷入僵局。全球氣候突變引發連鎖災難——太平洋海面封凍、埃及降雪，西山派遣的研究員在新幾內亞發現放射性巨型生物及變異食人族，被迫射殺被感染的下屬。日本本土遭受超紫外線侵襲引發大規模火災，全球糧倉相繼失守導致社會動蕩。西山妻子臨終前與丈夫訣別時，まり子體內已孕育新生命。面對持續惡化的災情，西山在國會用諾斯特拉達姆士預言模型推演人類滅絕路徑，最終促使首相做出重大政治抉擇。